阿克陶县是灌溉农业，水是农业的命脉，是绿洲上的生命之源。

“阿克陶”是柯尔克孜语白山的音译，白山，即为雪山，是全县的生命之源，绿色之源。阿克陶这颗帕米尔高原上的绿色明珠，是白山雪水孕育的、滋养的。

阿克陶县冰川面积达600平方公里，山区积雪面积为790平方公里，这些极为罕见的“固体水库”消融成为众多河流的源头，地表水极为丰富。全县地表水总径流量为28.2亿立方米，其中河水径流26.6亿立方米、泉水1.5亿立方米。山口以下地带，地质构造属塔里木盆地，莎车中新台至英吉沙与乌帕尔台地中间的库马断层，由于库山河、盖孜河的下切渗透，形成洪积凹陷地区。冲积扇下部地势平坦，形成地下水闭塞储存区，地下水较丰，总储量达3.6亿立方米。

阿克陶县境内河流属塔里木河流域，多发源于昆仑山脉、帕米尔高原上，由西南山区向东北平原而流。全县共有5大水系，即叶尔羌河水系，包括塔什库尔干河、帕斯热瓦提河、恰尔隆河三条河流；依格孜牙河及其支流青干河水系；库山河水系，其支流有卡拉塔布河、其木干河；盖孜河水系，其支流有奥依塔克河、木吉河、康西瓦尔河；玛尔坎苏河及其支流卡拉尔特河水系。农业灌溉用水主要引用库山河和盖孜河水，两河年径流量分别为6.36亿立方米和9.85亿立方米，以碳酸盐水为主，上游一般离子总量100～200克/升，呈弱碱性，水质较好。